以后再说X

欢迎光临~老上光显微镜

全国服务热线: 400-811-7895

新闻资讯
显微镜百科

菌液测序结果分析求助?

所属分类:显微镜百科 点击次数:255 发布日期:2022-07-02

大家好,这里是老上光显微镜知识课堂,在这里你可以学到所有关于显微镜知识,好的,请看下面文章:菌液测序结果分析求助? 来源:转载网络 作者: 546718069 菌液测序结果出来后。打开序列,先找载体接头,但大多数没有载体接头,有 的只有M13F有前面的接头序列,,这是什么情况??可不可以把没有找到接头序列的序列直接BLAST大神求助   用载体上的通用引物测序的话,引物和引物下游的一段是测不到的 测序结果应该就是你连到载体上的片段,你可以直接和你的理论序列比对看看你得到的序列是什么 用载体上的通用引物测序的话,引物和引物下游的一段是测不到的 测序结果应该就是你连到载体上的片段,你可以直接和你的理论序列比对看看你得到的序列是什么 非常感谢!原谅我是菜鸟,这样的话我有个疑问,我直接把测序的结果跟我的目的序列比对??不用blast么??还有,我直接把结果粘贴到NCBI上BLAST后,出来结果后,主要看哪个部分来确定是不是跟我的目的序列一致?   1.用通用引物测序,如果序列已插入,肯定可以测到你的上游引物及序列,至于下游引物能否测到取决于你的插入序列的大小,所以也可以直接在测序结果中找你的引物序列。 2.可以直接把你的测序结果拿去做blast,先初步判断结果中有没有你的目标片段。   我们可以帮您做 1.用通用引物测序,如果序列已插入,肯定可以测到你的上游引物及序列,至于下游引物能否测到取决于你的插入序列的大小,所以也可以直接在测序结果中找你的引物序列。 2.可以直接把你的测序结果拿去做blast,先初步 ... 谢谢,我直接Blast后,有我的目标基因,就是我附件里面的P450 6B1,但我设的引物所扩出来的目标片段应该是1463-615=848,可Blast 出来的那个长度  我看只有508? 我是不是可以认为我设计的引物是没问题的,下一步就可以根据我测序的结果序列进行原核表达了?   谢谢,我直接Blast后,有我的目标基因,就是我附件里面的P450 6B1,但我设的引物所扩出来的目标片段应该是1463-615=848,可Blast 出来的那个长度  我看只有508? 我是不是可以认为我设计的引物是没问题的,下一步就 ... 这个blast结果只是初步表明你的序列插入到载体中了,你仍然需要仔细查看测序结果,看是否有突变位点,避免无义突变。   这个blast结果只是初步表明你的序列插入到载体中了,你仍然需要仔细查看测序结果,看是否有突变位点,避免无义突变。... 非常感谢!能不能再讲一下下一步查看测序结果是否有突变位点的具体操作? 非常感谢!能不能再讲一下下一步查看测序结果是否有突变位点的具体操作?... 还是比对呀,用你的序列和测序结果比对,看有没有突变位点,如果是融合表达,还要看是否有移码突变。   你可以用软件如DNAman或DNAstar等软件进行两条序列比对,这个比较直观 你可以用软件如DNAman或DNAstar等软件进行两条序列比对,这个比较直观 哦哦!!GET新技能!非常感谢!! 非常感谢!原谅我是菜鸟,这样的话我有个疑问,我直接把测序的结果跟我的目的序列比对??不用blast么??还有,我直接把结果粘贴到NCBI上BLAST后,出来结果后,主要看哪个部分来确定是不是跟我的目的序列一致?... 你有目的序列就不用blast,直接用NTI软件比对你的标准序列和测序结果就可以了。你必须要知道载体接头处序列吗?一般只要目的序列正确,载体没啥问题。   网站网友点击量更高的文献目录排行榜: 点此链接 关注页面底部公众号,开通以下权限: 一、获得问题咨询权限。 二、获得工程师维修技术指导。 三、获得软件工程师在线指导 toupview,imageview,OLD-SG等软件技术支持。 四、请使用微信扫描首页底部官方账号!

首页 产品 手机 顶部